Scenariusz "Trzeciej granicy"napisał Adam Bahdaj na podstawie własnej książki pod tym samym tytułem.Inspiracją literackiego pierwowzoru stały się doświadczenia i przeżycia pisarza.
Wrzesień 1939 roku. Góral z Zakopanego, Andrzej Bukowian wraz z niedobitkami polskiej armii przekracza węgierską granicę. Wkrótce otrzymuje zadanie przeprowadzenia do Polski oficera, który ma organizować ruch oporu. Początkowo ma pewne opory, w końcu jednak decyduje się wykonać to zadanie.