W odcinkach 11 i 12 Anakin Skywalker i Obi-Wan Kenobi próbują porwać Hrabiego Dooku, ale cała trójka zostaje uwięziona przez piratów. Zmuszeniu do zawiązania nieoczekiwanego sojuszu, Jedi i Sith, z pomocą Jar Jar Binksa, opracowują plan ucieczki z rąk porywaczy. W odcinkach 13 i 14 Anakin zostaje poważnie zraniony w bitwie, a jego statek podczas lądowania rozbija się na odległej planecie. Aby go ocalić, Ahsoka i Aayla Secura proszą o pomoc Lurmenów, pokojowo nastawionych mieszkańców wioski. Kiedy jednak zostają niespodziewanie zaatakowani przez Separatystów, neutralni dotąd Lurmeni będą musieli zdecydować czy stanąć do walki, czy poddać się niszczycielskim najeźdźcom. W odcinku 15 Anakin i Obi-Wan przemierzają galaktykę aż do mroźnej planety Orto Plutonia, aby zbadać tajemnicze zniknięcie sił bezpieczeństwa klonów. W finałowym odcinku tej części Anakin i Obi-Wan zdobywają dowody na to, że w ich szeregach jest zdrajca.